闪光的夜袭故事发生在1931年的上海，第一次世界大战让各个国家都是一副满目疮痍的面孔，在战火和硝烟之后，存在着一个从未被载入史书的秘密组织，人们称它为“樱井机关”。这个组织收纳了一群拥有着特异功能的成员们，他们依靠着各自的能力，解决着发生在当时的各种各样疑难案件。                                                                    　　个性开朗作风轻浮的三好葵（吉野裕行 配音）、心高气傲刻板固执的伊波葛（浪川大辅 配音）、温文尔雅的千金大小姐苑树雪菜（生田善子 配音）以及其貌不扬对雪菜忠心耿耿的键谷枣（星野贵纪 配音），他们穿梭在死亡和危险之中，并且最终无法自持的被卷入了一个惊人的秘密之内。