我的医妃不好惹3主要讲述了女主作为穿越的现代的医生云若月，与楚国“第一战神”前太子楚玄辰互相成就与救赎的故事。战神是“杀戮”而医生是“救赎”，“白衣天使”救赎了“孤勇王爷”。楚玄辰天生潇洒倜傥，聪明睿智，有勇有谋，背负着弑父之仇，是云若月医人更医心，二人从互相嫌弃到放下偏见，再到互相欣赏终至一生一双人，感情徐徐展开，渐渐升华。在帮助楚玄辰完成家国天下的过程中患难与共，互相敞开心扉，同心协力，医治天下百姓，解决苍生疾苦，终得大成。