小小校长实验中学因长期教学成绩濒临倒闭，最后一学期无人愿意接手校长一职，教育局王局长无奈，只好找来初二女生薛小薇担任校长。她凭着自己一颗纯真、善良、执着的心，挑战了“潜规则”，处罚了校领导，以及众多棘手问题：维修桌椅省钱；向偏远山区穷困小学捐款；慰问敬老院老人；拒绝购买多余校服；让辍学同学返校；正确对待考试分数；教师家庭问题和学校财务公开等一系列事件，而最让她高兴的是期末考试取得了好成绩。王局长也对这次学生当校长实验性教学表示了肯定，母校顺利地保留下了学校，受到了社会各界的赞誉。这段艰辛的经历成为薛小薇一段美妙的回忆。