爱犬的奇迹故事发生在宁静的小山村里，在青山绿水的映衬下，石川优（船越英一郎 饰）带着一双儿女亮太（广田亮平 饰）和彩（佐佐木麻绪 饰），以及父亲优造（宇津井健 饰）过着平静而安详的生活。一日，亮太和彩在路边捡到了一只年幼的狗仔，在爷爷的帮助下，他们说服了有些顽固的父亲，收养了狗仔取名玛丽，就这样，玛丽在石川家的新生活开始了。　　时间流水一样的过去了，玛丽已经成年并且有了三个孩子，当人们以为快乐幸福的生活将一直伴随着他们的时候，一场6.8级大地震的袭来粉碎了这一梦想，优造和彩被压在了沉重的房梁之下，而此时唯一能够帮得上忙的只有玛丽。在玛丽的帮助下，救援队很快便发现了爷孙二人，可是用来救援的直升机无法负担更多的重量，玛丽和孩子们被留在了灾区。