魔力方咪咪与方甲甲姐弟俩在一个偶然的情况下被发现有特异功能。消息不胫而走，一时间，他们成了新闻人物。方家和学校从此忙碌起来，有的人要求甲甲、咪咪找一找祖上埋下的元宝；有的人请他俩去为患者透视看病；有的要他们去帮助破案；而学校的关校长却想利用他们去巴结领导从而得到的提拔。这时，华夏大学人体研究所的工作人员米兰提出要对他俩进行测试，以便带他们到北京参加特异功能研讨会……关校长为了讨好各方，不惜一女两嫁暗中得得，最终因为收受贿赂而受到了应有的惩处。在为外宾表演的专场中，咪咪和甲甲利用思维控制的功能使两位外宾情不自禁跳起了迪斯科，使中外宾客大饱眼福，世界特异功能表演大赛主持人查尔斯向姐弟俩发出了参赛邀请。自然之谜》杂志社总编胡梦龙和钱菲菲趁机以此为资本，办起了特异功能刊院，大雪骗取钱财。以满天飞和黄毛为道的流氓盗窃团伙。为了利用咪咪和甲甲帮助他们找到清代的稀世国宝，将姐弟俩劫持到一个地洞里。咪咪和甲甲不畏强暴、巧于周旋，最终在公安人员的配合下，利用自身的特异功能战胜了邪恶。胡梦龙被抓走；满天飞丧命；大疤脸和黄毛也被逮捕归案。姐弟俩幸福地回到了亲人的怀抱，随着科研人员米兰来到了北京。