摇曳百合第二季故事发生在氛围轻松制度宽松的七森中学，为了打发无聊的课后时光，个性天真单纯的少女赤座灯里（三上枝织 配音）伙同童年好友岁纳京子（大坪由佳 配音）与船见结衣（津田美波 配音），利用荒废已久的茶道社组成了一个名为“娱乐部”的活动社团。之后，又有表面善良内心却极为腹黑的女孩吉川千夏（大久保瑠美 配音）在误打误撞之中加入，就这样，这个山寨社团的四人小组成立了。　　在这个没有正式申请的社团中，每天都发生着欢乐又爆笑的日常，可是没过多久，娱乐部的存在便被学生会发现了。作为副部长，杉浦绫乃（藤田咲 配音）怎能对此坐视不管？在娱乐部和学生会之间，一场轰轰烈烈的猫鼠大战开始了。