灭门惨案之孽杀一部以大陆家庭为背景的伦理惨剧，麦惠芳(钟淑慧饰)虽是生长在一健全的家庭内，但她的家人却全都不当她是家中的一分子，还对她呼呼喝喝，又以她的后父麦泉(何家驹饰)更甚，一次更乘着酒意把她强奸了。惠把此事告诉其母，但她却无动于衷，惠只好离家投靠其男友小健(吴岱融饰)处。健是位严正的公安，对惠关怀体贴；惠怕被嫌弃，惟有把事件隐瞒。可是惠的后父麦食髓知味，更以强奸时所拍下的裸照作威胁，迫惠再次就范。惠深知这不是办法，遂持刀迫麦把底片交还，惜无法得逞，反而被麦再次强奸。健赶至见状，惊怒下开枪把麦击伤，纠缠中更被击晕。为免健遇害，盛怒下的惠拾枪把麦枪杀，并把母亲及一众弟妹逐一杀掉，健醒来知一切已无法挽救，只默然把所有指纹抹掉。然惠往公安局自首，公安(黄秋生饰)虽知惠是元凶，然而望着楚楚可怜的惠，觉得判这个女人杀人有罪，是否一个恰当的判决呢？阿惠(钟淑慧饰)是家中的养女，因此每日过着寄人篱下的压抑生活，某日，养父阿麦(何家驹饰)喝醉了酒，在醉意朦胧之中，他竟然丧尽天良地将阿惠强暴。受辱后的阿惠在家中孤立无援，便想到了男友阿奇(吴岱融饰)，然而，看到阿奇深爱自己的样子，于心不忍的阿惠选择了隐瞒实情。强暴事件之后，阿麦对于阿惠的骚扰变本加厉，他以阿惠的裸照相威胁，两人纠缠之际刚好被阿奇看到。愤怒的阿奇开枪打伤了阿麦后被击晕。愤怒之中，阿惠拾起枪将全家人杀死，后前往警局自首，将一切罪过揽到了自己身上，然而，接待她的警察在得知了实情之后对阿惠动了恻隐之心。